水晶的主要化学成份是二氧化硅，即石英石，化学式为SiO2。水晶跟普通砂子是“同出娘胎”的一种物质。当二氧化硅结晶完美时就是水晶；二氧化硅胶化脱水后就是玛瑙；二氧化硅含水的胶体凝固后就成为蛋白石；二氧化硅晶粒小于几微米时，就组成玉髓、燧石、次生石英岩。
纯净的无色透明的水晶是石英的变种。化学成分中含Si
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